Końcówki do irygatora zazwyczaj nie mają bezpośredniego kontaktu z jamą ustną – nie należy ich przytykać do zębów ani błon śluzowych. Wyjątek stanowią końcówki ortodontyczne, które posiadają pęczek włókien do oczyszczania zamków aparatu, oraz końcówki do kieszonek dziąsłowych, które można delikatnie przytknąć do zęba aby skierować strumień wody w kieszonkę. Standardowe końcówki do irygatora należy wymieniać mniej więcej raz na 6 miesięcy. Możemy poznać, że końcówka wymaga wymiany, gdy spada ciśnienie wody, a strumień przestaje być idealnie skupiony.